故事发生在名门高中椚椚丘中学的垫底班级——3年E班。这一学年，班级迎来了一位奇怪的班主任——他有着圆圆的黄色大脑袋和黏滑的触角，令人不寒而栗。原来，他就是不久前将月亮炸成月牙的罪魁祸首。为了应对即将来临的危机，乌间惟臣（椎名桔平 饰），日本防务省特种部队的精英，向学生们介绍了这个怪物的惊人能力：拥有20马赫的超速，普通武器对他完全无效。而这位怪物竟主动要求成为3年E班的班主任。为了阻止怪物在一年后摧毁地球，学生们被赋予了刺杀任务。在乌间的严格训练下，学生们逐渐成长，而与他们一同加入的还有杀手比琪（知英 饰）、智能机器人自律思考固定炮台（桥本环奈 饰）、转学生堀部系成（加藤清史郎 饰）及教官鹰冈明（高岛政伸 饰）等强大对手。面对无尽的刺杀挑战，这群学生将不得不全力以赴，与“杀老师”展开生死较量。